Novo México Aprova Programa de Mestrado em Anestesia na UNM

Sequenciamento rápido
Público alertado para Omicron após detecção rápida por cientistas da UNM
Detectando novas variantes do COVID-19 à medida que começam a se espalhar é um enorme desafio científico e logístico.
Mas graças a dois cientistas da Universidade do Novo México que estudaram e rastrearam a propagação do SARS-CoV-2 (o vírus que causa o COVID-19) desde o início da pandemia, a vigilância genômica é como sabíamos quando a variante Omicron foi lançada pela primeira vez. trazido para o Novo México.
Em dezembro de 2021, Darrell L. Dinwiddie, PhD, e Daryl Domman, PhD, co-líderes do programa de vigilância genômica SARS-CoV-2 no Centro de Ciências da Saúde da Universidade do Novo México (apoiado pelo Instituto Nacional de Ciências Médicas Gerais) , detectaram o primeiro caso conhecido da variante Omicron no estado, o que permitiu uma rápida resposta de saúde pública.

Tentamos fazer análises em tempo real onde obtemos amostras e as processamos para sequenciamento o mais rápido possível. Então podemos fornecer informações às autoridades de saúde pública e aos nossos médicos, porque as políticas podem ser alteradas quando há uma variante mais transmissível.
Dentro de uma semana de um paciente no Hospital UNM testando positivo para COVID-19, o laboratório de Domman, que lida com a análise das sequências do genoma SARS-CoV-2, determinou que a amostra era a variante Omicron.
Domman e Dinwiddie notificaram imediatamente o Departamento de Saúde do Novo México (DOH). No dia seguinte, o DOH conseguiu divulgar um anúncio de serviço público de que a Omicron havia chegado ao estado e incentivou precauções extras.
“Foi uma reviravolta bem rápida”, disse Dinwiddie.
Dinwiddie, professor assistente do Departamento de Pediatria da UNM, disse que estudar e rastrear o SARS-CoV-2 e suas variantes também foi útil no monitoramento da eficácia das vacinas.
“Quando começamos a ver uma redução na proteção de indivíduos vacinados quando surge uma nova cepa de SARS-CoV-2, é uma indicação de que talvez sua imunidade esteja diminuindo”, disse Dinwiddie. “Isso pode ser usado pelo CDC e pelo FDA para ver se eles precisam aprovar outro reforço”.
Antes da pandemia, Dinwiddie, professor assistente do Departamento de Medicina Interna, estudou outros vírus respiratórios usando testes genômicos, e o foco de Domman era a vigilância genômica da cólera em escala global. Domman disse que suas áreas de especialização se encaixaram bem quando chegou a hora de mudar o foco para o vírus SARS-CoV-2 no início de 2020.

Acho que temos habilidades realmente complementares. Acho que para nós dois foi uma transição muito fácil aplicar nossos conjuntos de habilidades ao SARS-CoV-2, e é por isso que conseguimos girar tão rapidamente e fazer as coisas acontecerem
“Acho que temos conjuntos de habilidades realmente complementares”, disse Domman. “Acho que para nós dois, foi uma transição muito fácil aplicar nossos conjuntos de habilidades ao SARS-CoV-2, e é por isso que conseguimos girar tão rapidamente e fazer as coisas acontecerem”.
Os dois sequenciaram amostras positivas para SARS-CoV-2 do Hospital UNM e de hospitais do Novo México, bem como de uma grande empresa de testes de diagnóstico chamada TriCore Reference Laboratories.
“Isso realmente nos deu uma visão de como o vírus estava sendo trazido para o estado e de onde essas infecções vinham”, disse Dinwiddie. “Então, poderíamos rastrear os que chegaram e levaram à disseminação da comunidade.”
Embora os EUA tenham melhorado drasticamente no trabalho de detetive genômico nos últimos dois anos, há uma coisa que os atrasou: testes caseiros de COVID-19.
Claro, os benefícios dos testes em casa superam os negativos, mas essas amostras positivas não são alimentadas no sistema de vigilância.
“Isso tem efeitos dramáticos não apenas para nós, mas para a contagem de casos”, disse Domman. “Em termos de acesso a amostras e entendimento do que está circulando no estado e regional e nacionalmente, essa é definitivamente uma questão que temos que superar.”
Para combater esse problema, Domman disse que seus esforços, juntamente com o TriCore e o DOH, o objetivo do Novo México é sequenciar pelo menos 5% de todos os casos positivos em um determinado mês.
"Essa é uma linha de base muito boa", disse ele. “Nesse nível, geralmente pegaremos as variantes e subvariantes que circulam pelo estado”.