Valor prognóstico e padrões de co-expressão de vias metabólicas em cânceres

Dan Zhang, Yan Guo e Ni Xie | 29 de dezembro de 2020
Contexto: Vias metabólicas anormais têm sido consideradas uma das marcas registradas do câncer. Enquanto
numerosas vias metabólicas foram estudadas em vários tipos de câncer, a ligação direta entre a via metabólica
a expressão gênica e o prognóstico do câncer não foram estabelecidos.
Resultados : Usando dois métodos de análise de bioinformática recentemente desenvolvidos, avaliamos o potencial de prognóstico de
expressão da via metabólica e desregulações tumor-versus-normal para até 29 vias metabólicas em 33 câncer
tipos. Os resultados mostram que o aumento da expressão do gene metabólico dentro dos tumores corresponde a um prognóstico ruim para o câncer.
A análise de co-expressão diferencial meta identificou quatro vias metabólicas com co-expressão global significativa
perturbação da rede entre o tumor e as amostras normais. Análise de expressão diferencial de vias metabólicas
também demonstrou forte perturbação da expressão gênica entre tumor pareado e amostras normais.
Conclusão: Tomados em conjunto, esses resultados sugerem fortemente que as expressões gênicas da via metabólica são
perturbado após tumorigênese. Dentro dos tumores, muitas vias metabólicas são reguladas positivamente para que as células tumorais ativem
metabolismos correspondentes para sustentar a energia necessária para a divisão celular.
Palavras-chave: Via metabólica, análise de meta co-expressão, pontuação composta de expressão gênica, câncer

A Autozigosidade Global Está Associada ao Risco de Câncer, Assinatura Mutacional e Prognóstico

Limin Jiang, Fei Guo, Jijun Tang, Shuguan Leng, Scott Ness, Fei Ye, Huining Kang, David C. Samuels e Yan Guo | 04 de dezembro de 2020
A autozigosidade global na forma de sequências de homozigosidade está associada a várias doenças. A razão de heterozigosidade, uma medida alternativa de autozigosidade global, é usada para avaliar o risco de câncer neste estudo. Nossa análise mostra associações fortes e consistentes entre as taxas de heterozigosidade e vários tipos de câncer. Uma análise mais aprofundada revela as conexões potenciais da razão de heterozigosidade com as assinaturas mutacionais e o prognóstico do câncer.